Structure et propriétés en chimie organique

I. Molécules de la chimie organique

Bon nombre de notions ont déjà été abordées en classe de première (à connaître donc !). Si les plus importantes sont rappelées dans la présente fiche, il est fortement recommandé d'aller réviser la fiche suivante :

Structure des entités organiques et familles des alcanes

1. Notion de chimie organique

$\bullet\quad$Définition :

$\quad\circ\quad$ Les molécules de la chimie organique sont principalement constituées des éléments carbone ($C$) et hydrogène ($H$).

$\quad\circ\quad$ Ces molécules peuvent également renfermer de l'oxygène ($O$), de l'azote ($N$), voire certains halogènes (tel que le chlore $Cl$).

$\quad\circ\quad$ Ce sont des molécules dont les atomes sont liés par des liaisons covalentes.

$\bullet\quad$Historiquement : composé du vivant.

$\bullet\quad$Actuellement : composé de carbone ($C$) (sauf $CO_2$, $CO$, etc.) avec de l'hydrogène ($H$), de l'oxygène ($O$) et/ou de l'azote ($N$).

$\bullet\quad$Cette forme de chimie sert à analyser et à synthétiser les corps organiques.

2. Groupes caractéristiques et famille chimique

$\textcolor{purple}{\text{a. Le carbone et ses liaisons}}$

$\bullet\quad$Pour savoir comment trouver la valence des atomes, il est nécessaire de réviser la fiche suivante :

Les molécules et les ions, entités plus stables chimiquement

$\bullet\quad$Rappel : une liaison covalente est une mise en commun de deux électrons de la couche externe.

$\bullet\quad$Cas de l'atome de carbone :

$\quad\circ\quad$ Son numéro atomique est $Z = 6$, ce dernier a donc $6$ électrons, répartis de la façon suivante : $1s^22s^{\textcolor{red}{2}}2p^{\textcolor{red}{2}}$ ($2 + 2 + 2 = 6$) ; ce dernier a donc $\textcolor{red}{4}$ électrons de valence.

$\quad\circ\quad$ Pour satisfaire à la règle de l'octet, l'atome de carbone doit donc compléter sa dernière sous-couche ($2p$) avec $4$ électrons en mettant en commun ses quatre électrons de valence avec d'autres atomes : il est tétravalent.

$\bullet\quad$Remarque : un hydrocarbure saturé ne contient que des atomes de carbone tétragonaux. Sinon, il est insaturé.

$\textcolor{purple}{\text{b. Squelette carboné et groupes caractéristiques}}$

$\bullet\quad$Une molécule organique, autre que celle d'un hydrocarbure, est constituée :

$\quad\circ\quad$ Du squelette carboné (c'est-à-dire de l'enchaînement des atomes de carbone constituant la molécule), ne comportant que du carbone et de l'hydrogène ;

$\quad\circ\quad$ D'un ou plusieurs groupe(s) caractéristique(s) comptant au moins un atome autre que $C$ et $H$ (par exemple $O$, $Cl$, $N$, etc.).

$\bullet\quad$Groupe caractéristique et famille chimique :

$\quad\circ\quad$ Un groupe caractéristique est un groupe d'atomes qui donne des propriétés spécifiques aux molécules qui le possèdent.

$\quad\circ\quad$ On dit que ces molécules (ayant le même groupe caractéristique) forment une famille chimique.

3. Formules chimiques

$\bullet\quad$Formule brute :

$\quad\circ\quad$ La formule brute d'une molécule organique indique les atomes la constituant et leurs quantités respectives.

$\quad\circ\quad$ Exemple : la formule brute du butane s'écrit $C_4H_{10}$.

$\bullet\quad$Formule semi-développée plane :

$\quad\circ\quad$ La formule semi-développée d'une molécule organique indique les atomes la constituant sans leurs doublets et les liaisons avec les atomes d'hydrogène ($H$) ne sont pas représentées.

$\quad\circ\quad$ Exemple : la formule semi-développée du butane s'écrit $CH_3-CH_2-CH_2-CH_3$.

$\bullet\quad$Formule topologique :

$\quad\circ\quad$ La formule topologique représente la chaîne carbonée par une ligne brisée. Chaque extrémité de segment représente un atome de carbone portant autant d'atomes d'hydrogène qu'il est nécessaire pour satisfaire à la règle de l'octet. Les atomes autres que $C$ sont représentés de manière explicite ainsi que les atomes d'hydrogène qu'ils portent (par exemple un groupement $OH$).

$\quad\circ\quad$ Exemple : $C_4H_{10}$ (le butane) se représente de la manière suivante sous forme topologique :

$\bullet\quad$Remarque : il existe d'autres manières d'écrire les formules chimiques des molécules organiques :

$\quad\circ\quad$ Formule de Lewis (vue en classe de 1^re) : on y voit les atomes ainsi que leurs doublets liants et non-liants ;

$\quad\circ\quad$ Formule développée plane : elle est identique à la formule de Lewis, mais les doublets non-liants ne sont pas visibles. Elle précise la nature et l'ordre d'enchaînement des liaisons entre les différents atomes d'une molécule.

4. Règles de nomenclature

Ces dernières ont été vues en classe de première, il est donc primordial de savoir exploiter des règles de nomenclature fournies pour nommer une espèce chimique ou représenter l’entité associée :

Structure des entités organiques et familles des alcanes

5. Structure, électronégativité et polarité d'une molécule

Ces notions ont également été introduites dans cette fiche en classe de première et sont donc également applicables pour les molécules organiques :

Electronégativité, liaison polarisée et polarité d'une molécule

II. Les chaînes carbonées saturées et insaturées

1. Les chaînes carbonées saturées (cycliques ou non)

Ces dernières ont été vues en classe de première, il est donc fortement recommandé de réviser la fiche suivante :

Structure des entités organiques et familles des alcanes

2. Les chaînes carbonées insaturées

$\bullet\quad$Chaîne carbonée insaturée :

Lorsqu'une molécule comporte au moins une double liaison, on dit qu'elle est insaturée.

$\bullet\quad$Remarque :

$\quad\circ\quad$ Les liaisons multiples sont dites insaturées (liaisons doubles ou triples).

$\quad\circ\quad$ Les chaînes carbonées insaturées contiennent donc au moins une liaison insaturée.

$\textcolor{purple}{\text{a. Les alcènes}}$

$\bullet\quad$Définition :

Les alcènes sont des hydrocarbures qui renferment une ou plusieurs liaison(s) double(s) (que la chaîne carbonée soit linéaire ou ramifiée) et ayant pour formule brute $C_{n}H_{2n}$.

$\bullet\quad$Nomenclature : on considère le nom de l'alcane correspondant (c'est-à-dire le même squelette carboné mais sans double liaison) pour lequel on remplace "ane" par "ène". Il faut repérer l'emplacement de la double liaison et le numéro du premier atome de carbone qui la porte. On intercale le numéro de ce carbone entre le radical et le suffixe "ène".

$\bullet\quad$Exemples :

$\quad\circ\quad$ $CH_2=CH-CH_2-CH_3$ est le but-1-ène ;

$\quad\circ\quad$ $CH_3-CH=CH-CH_3$ est le but-2-ène ;

$\quad\circ\quad$ Quelques molécules à nommer grâce à leurs formules topologiques :

$\textcolor{purple}{\text{b. Les alcynes}}$

$\bullet\quad$Définition :

Les alcynes sont des hydrocarbures possédant une ou plusieurs liaison(s) triple(s).

$\bullet\quad$Nomenclature : idem que pour les alcènes, mais l'on change "-ène" en "-yne".

$\bullet\quad$Exemple :

III. Les familles de molécules oxygénées

1. Rappels de première

$\textcolor{purple}{\text{a. L'oxygène et ses liaisons}}$

$\bullet\quad$Son numéro atomique est $Z = 8$, ce dernier a donc $8$ électrons, répartis de la façon suivante : $1s^22s^{\textcolor{red}{2}}2p^{\textcolor{red}{4}}$ ($2 + 2 + 4 = 8$) ; ce dernier a donc $\textcolor{red}{6}$ électrons de valence.

$\quad\circ\quad$ Pour satisfaire à la règle de l'octet, l'atome de carbone doit donc compléter sa dernière sous-couche ($2p$) avec $2$ électrons en mettant en commun ses deux électrons de valence avec d'autres atomes : il est divalent. Il peut donc établir $2$ liaisons covalentes : soit avec deux atomes différents, soit avec le même atome (liaison double).

$\textcolor{purple}{\text{b. Familles fonctionnelles vues en première}}$

Les familles de molécules oxygénées vues en 1^re sont les alcools, les aldéhydes, les cétones et les acides carboxyliques :

Les familles de molécules organiques oxygénées

2. Nouvelles familles de molécules oxygénées

$\bullet\quad$Le §I. a pu rappeler qu'un groupe caractéristique est un groupe d'atomes qui donne des propriétés spécifiques aux molécules qui le possèdent, formant entre elles une famille chimique.

$\bullet\quad$Il existe d'autres familles de molécules oxygénées non vues en classe de 1^re : les halogénoalcanes, les amines, les amides et les esters.

$\textcolor{purple}{\text{a. Les halogénoalcanes}}$

$\bullet\quad$Les halogénoalcanes sont des molécules qui contiennent au moins un groupe caractéristique halogéno $-X$, $X$ étant un atome de la famille des halogènes : $F$ (fluor), $Cl$ (chlore), $Br$ (brome) ou $I$ (iode).

$\bullet\quad$Exemple : le dichlorométhane $CH_2-Cl_2$

$\bullet\quad$Test caractéristique : on utilise une solution de nitrate d'argent. Si on se trouve en présence d'un composé halogéné, on obtient alors un précipité d'halogénure d'argent.

$\bullet\quad$Nomenclature : on rajoute préfixe "fluoro", "chloro", "bromo" ou "iodo" au nom de l'alcane dont il dérive.

$\textcolor{purple}{\text{b. Les amines}}$

$\bullet\quad$Les amines sont des molécules qui contiennent le groupe caractéristique amino $-NH_2$. Il s'agit de composés azotés dérivant de l'ammoniac $NH_3$ par remplacement d'un ou plusieurs atomes d'hydrogène par des groupes carbonés.

Les amines à chaîne carbonée saturée ont pour formule générale $C_nH_{2n+3}N$.

$\bullet\quad$Par analogie avec les alcools, la classe de l'amine est définie par le nombre $n$ d'atomes d'hydrogène liés à l'azote : on distingue ainsi les amines primaires (I), secondaires (II) et tertiaires (III).

$\bullet\quad$Exemples :

$\quad\circ\quad$ Le méthanamine est une amine I : $CH_3-NH_2$ ;

$\quad\circ\quad$ Le N-méthylméthanamine est une amine II : $CH_3-NH-CH_3$ ;

$\quad\circ\quad$ Le triméthylamine de formule $N(CH_3)_3$ est une amine III :

$\bullet\quad$Test caractéristique : test de $pH$ (ce sont des espèces basiques en solution aqueuse). Elles font partie des couples acido-basiques ion alkylammonium / amine ($R-NH_3^+$ / $R-NH_2$). Elles réagissent avec l'eau selon l'équation :

$R-NH_2 + H_2O \longrightarrow R-NH_3^+ + HO^-$

Ce sont les ions hydroxyde les responsables de la basicité en solution aqueuse.

$\bullet\quad$Nomenclature : leur nom officiel s'obtient en remplaçant le "e" final de l'alcane dont il dérive par le suffixe amine. Une nomenclature plus courante (nomenclature radico-fonctionnelle) consiste à ajouter le suffixe amine au nom du radical $\text{alkyle} -R$ après en avoir supprimé le "e" final.

$\bullet\quad$Remarque : la fonction amine recouvre un ensemble très étendu de composés, par exemple :

$\quad\circ\quad$ Les acides aminés comme l'acide 2-aminopropanoïque également appelé alanine ;

$\quad\circ\quad$ Les alcaloïdes comme la caféine :

$\textcolor{purple}{\text{c. Les amides}}$

$\bullet\quad$Les amides sont des molécules qui contiennent un groupe caractéristique amino $-NH_2$ lié à un groupe carbonyle $-C=O$.

Les amides à chaîne carbonée saturée ont pour formule générale $C_nH_{2n+1}NO$.

$\bullet\quad$Par analogie avec les amines, la classe de l'amide est définie par le nombre $n$ d'atomes d'hydrogène liés à l'azote : on distingue ainsi les amides primaires (I), secondaires (II) et tertiaires (III).

$\bullet\quad$Nomenclature : un amide dérive de celui de l’acide carboxylique de même chaîne carbonée. La terminaison finale « oïque » de l’acide est remplacée par la terminaison « amide » et le mot « acide » est supprimé.

$\textcolor{purple}{\text{d. Les esters}}$

$\bullet\quad$Les esters sont des composés organiques de formule semi-développée $R-COO-R'$, où $R$ et $R'$ sont deux groupements alkyle de la forme $C_nH_{2n+1}$.

La chaîne carbonée principale correspond à $R-COO-$.

$\bullet\quad$La formation d'un ester (transformation dite d'estérification) se fait à partir d'un acide carboxylique et d'un alcool :

$\small R-COOH + R'-OH \rightleftharpoons R-COO-R' + H_2O$

$\Longleftrightarrow$

$\scriptsize\text{acide carboxylique + alcool} \rightleftharpoons \text{ester + eau}$

$\bullet\quad$Exemple : $\small CH_3CH_2CO_2CH_3 + H_2O \rightleftharpoons CH_3CH_2COOH + CH_3OH$

$\iff$

$\scriptsize \text{Propanoate de méthyle + eau} \rightleftharpoons \text{acide propanoïque + méthanol}$

$\bullet\quad$Nomenclature : le nom de l'ester est composé :<

$\quad\circ\quad$ Du nom de l'acide carboxylique suivi du terme "oate" ;

$\quad\circ\quad$ Du nom de l'alcool suivi du terme "yle".

$\quad\circ\quad$ Schématiquement l'appellation de l'ester $R-COO-R'$ correspond à $R-C-\text{oate}$ de $R'- \text{yle}$.

$\bullet\quad$Exemple : le propanoate de méthyle est l'ester de l'acide propanoïque et du méthanol.

$\bullet\quad$Test caractéristique : on utilise une solution de soude (hydroxyde de sodium). Si on se trouve en présence d'un ester, on obtient alors un précipité d'acide carboxylique et d'alcool.

$\bullet\quad$Remarque : les esters sont des composés très utilisés dans l'industrie alimentaire, cosmétique et pharmaceutique.

IV. Isomérie de constitution

1. Notion d'isomérie

$\bullet\quad$Des molécules sont dites isomères si elles sont différentes mais ont des formules brutes identiques.

$\bullet\quad$Remarque : les molécules de deux isomères ne sont pas superposables.

2. Les isomères de constitution

$\bullet\quad$Des isomères de constitution ont la même formule brute mais des formules planes différentes (les squelettes carbonés sont différents).

$\bullet\quad$On distingue plusieurs types d'isomères de constitution :

$\quad\circ\quad$ Les isomères de chaîne : seul le squelette carboné change. Par exemple : $C_4H_{10}$.

$\quad\circ\quad$ Les isomères de position où un groupe caractéristique ou une instauration occupe une position différente sur un squelette carboné inchangé. Par exemple : $C_4H_9Cl$.

$\quad\circ\quad$ Les isomères de fonction pour lesquels le groupe caractéristique diffère. Par exemple, l'éthanol $CH_3-CH_2-CH_2OH$ et l'étheroxyde $CH_3-O-CH_2-CH_3$.

_{= Merci à gbm et shadowmiko pour avoir contribué à l'élaboration de cette fiche =}